С 1457 года замок становится резиденцией Великого магистра Немецкого ордена. В 1579-1594 г.г. - строительство западного флигеля замка с кирхой и залом Московитов. В 1697 году в замке принимают Великое посольство Петра I. 1701 год - в замковой кирхе коронация первого прусского короля Фридриха I. В период с 1758 по 1762 г.г. во время Семилетней войны, замок становится резиденцией российских губернаторов, в том числе генерал-губернатора Василия Суворова. Зимой 1760 - 1761 г.г. пребывание в замке А.В.Суворова.

В 1807 году в период Наполеоновской компании, пребывание в замке Наполеона Бонапарта, а позже Александра II.

С 1925 года размещение в замке Восточно-Прусского провинциального музея - позже Музея "Пруссия". Музей обладал уникальными коллекциями археологии, этнографии, произведений кенигсбергских ремесленников, церковного искусства. Имелись также - архив, библиотека, художественная галерея.

Значительная часть коллекция находится в настоящее время в фондах Калининградского областного историко-художественного музея.

В период с 1959 по 1976 годы руины Королевского замка (замок горел в августе 1944 г. во время налета английской авиации) были окончательно разобраны, а на их месте разместилась площадь "Центральная".

С 2001 по 2005 годы на территории площади работниками Калининградского областного историко0-художественного музея и Балтийской экспедиции ИА РАН, при финансовой поддержке журнала "Шпигель" (г.Гамбург, Германия), Мэри города, Управления культуры Администрации области, производятся археологические раскопки.

К июлю 2005 года вскрыты фундаменты главной башни, раскопаны подвальные помещения Западного флигеля (около 750 кв.м).

Управлением культуры Администрации области, при поддержке Федерального агентства по культуре и кинематографии планируется создать на месте раскопок музей под открытым небом с последующей консервацией руин.

В настоящее время имеется смотровая, демонстрационная площадка с выставкой находок и стендами, для показа иллюстративных материалов по истории замка.

В процессе археологических раскопок собрана большая коллекция археологических и исторических материалов (более 5 тыс. ед.), поступивших в фонды КОИХМ. Наиболее интересны каменные ядра XIV века, мечи, наконечники копий и дротиков, ножи XIV - XIX в.в., детали интерьеров, предметы быта, украшения XIV - нач. XX в.в.Сенсационной стала находка коллекции ритуальных предметов - 11 единиц в футляре, из серебра, золота и других металлов, XVII - XVIII в.в. и, возможно, принадлежавшая придворному астрологу. В настоящий момент раскопки продолжаются.

Руководитель рабочей группы музея на раскопках Королевского замка Старший научный сотрудник КОИХМ Анатолий Валуев.